Beitritt Kroatiens ist GLS landesweit mit eigenem Netz präsent. Mit zunächst vier Standorten in Zagreb, Rijeka, Split und Osijek startet GLS in Kroatien. Sie wurden seit der Gründung des Unternehmens Ende Mai dies es Jahres eingerichtet. Zuvor hatte die GLS Gruppe Kroatien in Kooperation mit einem Netzwerkpartner bedient.
Das Depot bei Zagreb (Popovec) dient zusätzlich als nationales Verteilzentrum. Über Zagreb laufen ab dem 1. September 2013 auch die internationalen GLS Transporte. Tägliche Linienverkehre verbinden Kroatien in Richtung Westen mit Ljubljana (Slowenien), Ansfelden (Österreich) und dem GLS Europa hub in Neuenstein (Deutschland).